2003年12月31日，清华大学在长三角地区设立的唯一研究院——浙江清华长三角研究院（总部）正式签约入驻嘉兴南湖区科技城。
全新的“科技城”概念
吻合清华大学的“择偶标准”
2003年初，清华大学在长三角地区发出“选秀”通告，浙江、江苏、上海三大长三角地区的县市区开始展开激烈的争夺战。激战进入白热化阶段，浙江嘉兴的南湖、嘉善、平湖，绍兴的上虞，杭州的萧山这五个县市区进行最后的晋级战。
2003年，清华大学的专家多次到嘉兴考察，嘉兴给他们的印象十分深刻。原来，为了推动清华大学落户嘉兴，嘉兴市政府成立了推进委员会，由十多位来自各个部门的精英分子组成。十多位成员每日每夜赶着整理资料迎接清华大学研究员的考察，他们把嘉兴的区位优势、经济实力以及合作可能通过PPT图文并茂地演示出来，这让清华大学的专家耳目一新。
“清华大学最后把研究院设在嘉兴南湖区，我想原因有两个。第一，从地理位置上看，嘉兴是真正的长三角中心，它离上海、杭州、苏州都只要一个多小时的车程，跨海大桥即将建成，它到宁波的车程也只要一个多小时。在嘉兴设研究院，它的影响力能够真正地辐射到长三角的各个城市。第二，南湖区副区长、科技城管委会主任孙旭阳提出了具有创新意义的‘科技城’概念。”
那么，“科技城”的概念到底新在哪里？嘉兴科技城管委会副主任沈晶解释，它不同于一般的以建设经济开发区来集聚高新技术产业园区的概念，它是通过建立科技城，集聚科研机构、科研人才和信息。前者以大规模建立产业为主，后者则主要集聚科研机构，推动科技成果的转化，催发创新技术。相比之下，后者符合清华大学的“择偶标准”，更能发挥清华大学的作用和特长。于是，一拍即合。
在南湖区科技城设立了浙江清华长三角研究院（总部）后，清华大学又在嘉善和平湖设立了分部。其中，平湖以光机电研究为主，嘉善以生物医药为主，南湖区总部以电子信息、环保、海洋工程为主，并成立清华大学教育培训中心。
——摘自《南湖晚报》 2007年7月15日